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Please use this identifier to cite or link to this item: http://hdl.handle.net/1807/20176


Title: Identificacin de eptopos conformacionales
Issue Date: 31-Dec-2001
Publisher: Elfos Scientiae
Citation: Biotecnologia Aplicada (ISSN: 0684-4551) Vol 18 Num 2
Abstract: Biotecnolog√≠a Aplicada, Vol. 18, No. 2, April 2001, pp. 91-93 Identificacin de eptopos conformacionales Anna Tramontano Code Number: ba01014 RESUMEN: En la actualidad, se ha difundido bastante el uso de mtodos eficientes de biologa molecular para seleccionar secuencias peptdicas capaces de imitar regiones de una protena que interactan con otras molculas. Esto trae consigo la dificultad de identificar qu parte de la superficie de la protena es imitada por el pptido seleccionado. Una va posible es la generacin y almacenamiento en una base de datos, de todas las secuencias peptdicas posibles que pueden imitar la superficie de una protena de estructura conocida. Las secuencias de los pptidos seleccionados se utilizan para buscar en la base de datos y ubicar regiones de interaccin como los eptopos reconocidos por anticuerpos. En este artculo se describe la aplicacin de este mtodo. Se tomaron como ejemplo los resultados de un tamizaje realizado a una biblioteca peptdica con un anticuerpo monoclonal especfico contra la cadena H de la ferritina srica humana. La localizacin del eptopo identificado coincide satisfactoriamente con los datos disponibles en la literatura sobre el complejo ferritina-anticuerpo. PALABRAS CLAVES: bibliotecas peptdicas, bsqueda en bases de datos, eptopos, ferritina ABSTRACT: Identification of Conformational Epitopes. Efficient methods for selecting peptide sequences able to mimic interacting regions of a protein surface are nowadays widely used in molecular biology. This leads to the problem of identifying which part of the protein surface is mimicked by the selected peptide. One possible method is to generate and store in a data base all possible peptides able to mimic the surface of a protein of known structure. Selected mimicking peptide sequences can be used to search the data base efficiently and to locate interacting regions, such as antibody epitopes. Here the application of such a method is described. The results of a phage library screening performed using a monoclonal antibody raised against human H-ferritin are used as a case study. The location of the identified epitope is in excellent agreement with all the data available on the antibody-ferritin complex. KEYWORDS: data base search, epitopes, ferritin, peptide libraries Copyright 2001 Elfos Scientiae
URI: http://hdl.handle.net/1807/20176
Other Identifiers: http://www.bioline.org.br/abstract?id=ba01014
Rights: Copyright 2001 Elfos Scientiae
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